La réponse est ici :
http://doc.ubuntu-fr.org/applications/mozilla-thunderbird_import_export

En résumé :

 Télécharger le fichier xpi (version actuelle 5.2) : https://nic-nac-project.de/ kaosmos/mboximport-en.html

 Dans Thunderbird, aller dans "Outils” -> "Extensions” et cliquer sur "installer”

 Chercher le fichier xpi que vous avez téléchargé précédemment.

 Redémarrer Thunderbird.

Dans Evolution :

 Sélectionner tous les messages à exporter vers Thunderbird, dossier par dossier.

 CTRL+S (ou fichier / Enregistrer sous) pour chaque dossier vers dossier_xyz.mbx (format mbox)

Ouvrir Thunderbird :

 Choisir un dossier

 Faire "Outil” ⇒ "Importer/Exporter mbox” ⇒ "Importer un fichier mbox”

 Chercher les fichiers créés ci-dessus, dossiers_xyz.mbx.

Attention à ceci :

 N.B : Avec un compte IMAP, l"importation de courriers est impossible et l"exportation ne pourra se faire qu"a partir de dossiers "hors ligne”.

 Vous pouvez importez plusieurs fichier mbox en une seul fois.

 Les fichiers sont importés comme s’ils étaient des mails reçus, et donc l’expéditeur est affiché mais pas le destinataire. Si vous souhaitez voir afficher le destinataire, vous devez importer le fichier comme sous-dossiers du répertoire "Reçus". (Pour cela, créez vous un nouveau compte local, par exemple, et importez les mbox dans le dossier ou des sous-dossiers du dossier thunderbird "Courier entrant" de ce compte.